上海市防汛指挥系统主要包括四个部分：

1、信息采集：汇聚整合了气象、海洋、海事、水文、水利、供水、排水等行业10余个实时监测系统。包括了流域、上海及近海的气象、水情、雨情、风情、汛情等信息。测站遍布全市80个水文站点、93个水闸泵站、14个气象站，中心城区160个排水泵站、36个积水点，近海13个潮位站，流域44个水位站。数据更新频率通常是每5分钟一次。

2、决策支持：定期更新防汛工作联络网、防汛设施基础资料库、防汛专家资源库、预警预案管理库和抢险队伍物资库等信息，探索了防汛应急管理的数字化和地图化。针对处于平原感潮河网的特大城市防汛，实现了对暴雨积水、台风暴潮、区域性洪水的统计分析、预警预报和风险评估，为防汛指挥提供决策支持。

3、信息发布：通过防汛专网、市公务网、市政务网、国际互联网、集群电话、集群传真、集群短信等手段，面向全市各级防汛部门、政府部门和社会公众提供准确、及时、全方位、多层次的信息服务。

4、指挥会商：接入整合了防汛、气象、水利、公安等部门400多个点的监控图像，对防汛重要部位进行实时视频监控；开通了市民灾情报送热线，通过与110、城建热线、水务热线联动，实时反映和及时处置道路积水、屋顶漏水、树木倒伏等灾情险情信息；形成了国家防总、市防汛指挥部、区县防汛指挥部等32个分会场的多级视频会商。